A Habilitação Neuropsicológica é uma área de intervenção transversal a quase todos, se não todos, os casos de intervenção em Psicologia Clínica e Psicoterapia intervencionados na Saberdemim. Tem como principal quadro teórico o conhecimento científico da neurodinâmica cerebral (seu funcionamento e desenvolvimento anatómico e funcional)  enquadrando-o na prática clínica das diferentes especialidades. Tem como foco de intervenção o planeamento da atividade terapêutica que intencionalmente responda directamente ao desenvolvimento de diferentes arranjos neuronais responsáveis pela evolução de diferentes competências, sem as quais, a intervenção por outras especialidades é na maior parte das vezes ineficaz ou insuficiente. Esta situação tem principal impacto nas perturbações do neurodesenvolvimento, no entanto, estão igualmente presentes em diferentes quadros clínicos de cariz mais emocional, relacional e mesmo comportamental.